Espace collaboratif en biotechnologie et ressources numériques en biochimie génie biologique

Référentiel du C2i niveau 1 et enseignement de l'informatique dans les STS de biologie technique : un témoignage

fabrice.martin — 2011-04-19T13:28:37Z

Le Certificat informatique et internet niveau 1 (C2i niveau 1) peut être présenté comme le prolongement post-bac du B2i lycée . Pour plus de renseignements : http://www.c2imes.org/

Ce certificat atteste des compétences en informatique usuelle. Il est basé sur un référentiel découpé en neuf domaines .

Le C2i niveau 1 est mis en place depuis deux ans, à titre expérimental, dans notre STS Bio-Analyses et Contrôles (Lycée Marie Curie, Marseille). Seuls les moyens horaires et les contenus des enseignements d'informatique initialement fixés par le référentiel du BTS ont pu être utilisés. Il a donc fallu chercher les correspondances entre les items du référentiel du C2i niveau 1 et les usages de l'informatique déjà en place dans notre STS Bio-analyses et contrôles. Le tableau pdf joint montre ces correspondances : certaines sont presque directes, d'autres ont nécessité quelques développements spécifiques.

Au final, il semble assez simple de faire correspondre le référentiel du C2i niveau 1 et les usages de l'informatique dans les STS de notre domaine : en Bio-analyses et contrôles, certes, mais aussi en Analyses de Biologie Médicale et en Biotechnologies.

Au-delà de la certification à proprement parler, l'utilisation de ce référentiel C2i dans le cadre de nos STS s'avère être un outil de formation intéressant et efficace pour améliorer les pratiques informatiques de nos étudiants dans les domaines personnel et professionnel.

Amplification et mise en évidence par PCR d'un insert

Lycée Simone Weil Le Puye en Velay — 2010-11-06T19:57:50Z

PCR, bioinformatique - InfoPratique

L'enseignement d'exploration Biotechnologies

Mostafa Kriat — 2010-03-19T15:59:39Z

L'enseignement d'exploration "Biotechnologies" permet aux élèves de découvrir l'univers des biotechnologies et de la biologie appliquée. Cet enseignement est basé sur des activités technologiques empruntées aux domaines de la santé (diagnostic médical, traitement, prévention), des bioindustries pharmaceutiques, cosmétiques et agro-alimentaires et de l'environnement (pollution-dépollution, contrôles de l'eau, de l'air, du sol...). Pratique et pluridisciplinaire l'enseignement "Biotechnologies" s'appuie sur la microbiologie, la biochimie, la biologie cellulaire et l'immunologie. Il développe des compétences fondamentales : autonomie, sens de l'observation, rigueur du raisonnement et démarche expérimentale, nécessaires à une poursuite d'études scientifique. Après la seconde, les élèves peuvent poursuivre dans la filière STL Biotechnologies, voie scientifique alternative à la filière S et obtenir un baccalauréat STL option Biotechnologies (Ancien STL Biochimie génie biologique).


biochimie


immunologie


microbiologie


microscopie


tice

Guide d'utilisation de la CCFthèque

Mostafa Kriat — 2010-03-06T13:20:16Z

Étape 1 : préparer votre fichier

Avant de publier un article dans la CCFthèque, il est nécessaire de préparer votre fichier .
Rassembler dans un fichier unique au format doc (word 2000 ou 2003) contenant : le sujet + la matière d'œuvre + la grille d'évaluation
nommer votre fichier (sans espace, sans accent et en majuscules) comme suit : BTS_MATIERE_SITUATION_LYCEE_ANNEE (ex BTK_BCH_SE1A_LMC_2010). Si l'auteur souhaite indiquer son identité il peut la préciser dans un entête ou un pieds de page du corps de texte.

Code BTS :
- ABM : Analyses de biologie médicale ;
- BIOAC : Bioanalyses et contrôles ;
- BTK : biotechnologies ;

Code matière :
- BCH : biochimie ;
- MIB : microbiologie ;
- BMG : biologie moléculaire et génie génétique ;
- BCM : biologie cellulaire (moléculaire) ;
- HEM : hématologie ;

Code situation d'évaluation :
- SE1A : première situation d'évaluation du groupe A ;
- SE2B : deuxième situation d'évaluation du groupe B ;

Code lycée
- LJF : Lycée Jules Ferry (Cannes) ;
- LMC : Lycée Marie Curie (Marseille) ;
- LMD : Lycée la Martinière la Duchère (Lyon) ;
- LSW : Lycée Simone Weil (Le Puy) ;
- JMM : lycée jean Mermoz (Montpellier) ;
- NDT : lycée Notre Dame Toulon (Toulon) ;
- TOQ : lycée Tocqueville (Grasse) ;
- SAL : lycée Saliège (Toulouse) ;
- LAC : lycée Dr Lacroix (Narbonne) ;

Code année : code à 4 chiffres de l'année correspondant du déroulement de la SE.

Étape 2 : rédiger un article court avec titre et mots clés

cliquer sur le lien Rédaction du menu horizontal haut du site geniebio
se connecter avec les codes fournis pour votre établissement


redac

une fois dans la zone de rédaction, cliquer sur le bouton Edition > la rubrique CCFthèque >> nom du BTS
sélectionner ensuite la sous-rubrique correspondant au nom du BTS : ex : BTS Biotechnologies


ecrire_article

saisir un Titre explicite pour votre sujet (ex : suivi d'une purification de phosphatase alcaline. Cela peut correspondre au chapeau du sujet.
dans la zone Texte, saisir le nom des manipulations clés (ex : dosage des protéines, activité PAL, SDS-PAGE...)
cliquer sur enregistrer pour sauvegarder l'article

Étape 3 : charger le fichier sur le serveur

Après enregistrement de l'article :
dans la zone Joindre un document présent en bas de l'article que vous venez d'enregistrer, cliquer sur le bouton Parcourir et pointer le fichier texte de votre évaluation présent sur votre ordinateur
n'oubliez pas de cliquer ensuite sur le bouton Télécharger
pour supprimer un fichier déjà chargé sur le serveur, il suffit de cliquer sur le bouton supprimer qui apparaît en rouge. Une fois le téléchargement terminé, vous pouvez valider la publication de l'article en modifiant son statut.


article_complet

Étape 4 : consulter et télécharger les fichiers de la CCFthèque

cliquer sur le lien Rédaction du menu horizontal de la page d'accueil du site geniebio
se connecter avec les codes fournis pour votre établissement
revenir sur la page d'accueil du site geniebio
la rubrique CCFthèque devient visible dans le menu latéral droit et vous permettra de naviguer dans les sous rubriques et télécharger les fichiers qui apparaissent comme des fichiers joints.

Etat frais

Mostafa Kriat — 2010-03-06T12:58:47Z

Etat frais en vidéo


Etat frais: Etat frais

Les astuces de la recherche avancée avec Google

Mostafa Kriat — 2008-09-17T18:33:00Z

Quelques astuces de la recherche avec google.

Utiliser les guillemets pour la recherche d'une expression. Exemple : "la réplication de l'ADN" , "la division cellulaire"

Utiliser l'opérateur « + » ou « - » pour imposer ou éviter la présence d'un mot-clé ou une expression. Exemple : puces +ADN ou puces -ADN . C'est selon…

Limiter la recherche à un site en particulier. Exemple : site:upbm.org "annales bac STL BGB" . Permet de rechercher de l'expression annales bac STL BGB uniquement sur le site upbm.org.

Utiliser la fonction define pour rechercher plusieurs définitions d'un même mot. Exemple define:qualité

Utiliser le filtre de la recherche avancée pour chercher des informations dans des formats de spécifiques. Cf le lien recherche avancée du moteur exemle 1 : mitose filetype:swf (animation flash) exemple 2 : "les maladies mitochondriales" filetype:pdf (recherche de l'expression dans un fichier pdf) exemple 3 : "les puces à ADN" filetype:ppt (recherche de l'expression dans un fichier type diaporama) exemple 4 : "dosage du glucose" filetype:xls

Pensez à explorer le lien recherche avancée de google.

Les informations sur le web

Mostafa Kriat — 2008-09-10T06:06:14Z

Les informations diffusées sur certains sites web sont approximatives voire fausses. Il est nécessaire d'apprendre à croiser les informations et à évaluer la validité et la pertinence des informations diffusées. Un exercice simple avec Google pour illustrer cela. Exercice
recherche de l'expression "la méditerranée" en mettant les guillemets. La recherche se fait uniquement sur les pages comprenant cette expression exacte.
en fait varier l'orthographe du mot en fonction de votre humeur

Voici les statistiques (attention les résultats sont fluctuants en fonction notamment de l'occurrence du mot dans l'actualité et des serveurs Google consultés) : "la méditerranée" : 5 950 000 "la méditerrannée" : 96 800 "la méditerannée" : 54 400 "la méditeranée" 22 400 "la méditerrané" : 24 200 "la méditerané" : 1300 "la méditteranée" : 660 "la méditterranée" : 442 "la méditterannée" : 690 "la méditterrannée" : 160 "la médditerrannée" ??? : 6 etc... Dans le cas de l'orthographe, les moteurs proposent en général une correction en se basant sur le nombre d'occurrences. Mais qu'en est il des informations scientifiques ? les confusions virus/bactérie/ parasite, les schémas erronés et les théories fumeuses ne sont pas détectables et surtout par les élèves…d'où l'intérêt de multiplier les sources, de croiser les information, de consulter les livres papier ou en ligne (voir http://books.google.fr/) et de connaitre quelques critères d'évaluation de la qualité des sites web.

Mise en place du CCF en BTS ABM

Mostafa Kriat — 2008-09-07T20:27:00Z

Le CCF en BTS ABM

Diaporama sur le CCF en général et sa mise en place en BTS ABM avec un exemple de fiche de synthèse.


Fiche de synthèse U51 U52 et U53

Fiche de synthèse U51 (Biochimie) U52 (Microbiologie) et U53 (hématologie)vierges

Analyses de biochimie médicale


Fiche de synthèse U51 U52 et U53

Mise à jour septembre 2008 Les fiches vierges ont été fournies par l'IPR et complétées par le groupe de travail sur le CCF lors de la réunion sur le CCF de juin 2007.

Mise en place du CCF en BTS Biotechnologies

Mostafa Kriat — 2008-09-07T06:27:00Z

Le CCF en BTS Biotechnologies

Fiche de synthèse U51 vierge TP de Biologie moléculaire et génie génétique	U51 TP Biologie moléculaire et génie génétique
Fiche de synthèse U52 vierge TP de Biochimie des protéines	U52 TP de Biochimie des protéines
Fiche de synthèse U53 vierge TP de Microbiologie et de génie fermentaire	U53 TP de microbiologie et de génie fermentaire
Fiche de synthèse U54 vierge TP de Biologie cellulaire	U54 TP de Biologie Cellulaire

Mise à jour septembre 2008

Documents fournis par l'IPR lors de la réunion de travail sur le CCF de juin 2007.

Stage bioinformatique avril 2008

Mostafa Kriat — 2008-08-26T18:23:05Z

Stage de formation avril 2008 : initiation à la bioinformatique

Présentation générale de la bioinformatique	banques et portails bioinformatiques
Banques et portails bioinformatiques	Initiation bioinformatique Diaporama Initiation bioinformatique et ses outils
Principe de comparaison des séquences	Principe comparaison de séquences
Liens pour les outils bioinformatiques	Liens pour les outils bioinformatiques
Exercices de bioinformatique de base
Fichiers séquences exercices	fichier pcr_product fragment_F_listeria. txt
Principe de dessin des amorces	Principe de dessin des amorces
Principe de la prédiction des gènes

Stage réalisé au lycée Marie Curie à Marseille et Jules Ferry à cannes